ntfsclone è fantastico. L'ho usato con grande successo per clonare sistemi e per scopi di backup.
Se la tua partizione Windows non utilizza NTFS, dd dovrebbe occuparsi di te, anche se non è molto efficiente.
dd sembrerebbe essere la scelta giusta qui. Il comando sarebbe simile al seguente...sostituisci il dispositivo e il file di output con quello che desideri.
dd if=/dev/sda1 of=~/windows.img
C'è anche partimage e ghost4linux. Ma per qualcosa di simile, entrambe possono essere cose eccessive e complicate.
Immagine parziale
Sicuramente una buona opzione http://www.partimage.org/Main_Page. È possibile creare un'immagine e comprimerla per risparmiare spazio su disco, e possono essere suddivise in più file da copiare su CD/DVD. Le partizioni possono anche essere salvate attraverso la rete.