RStudio non ha un correttore ortografico durante la digitazione; dovrai invocare il controllo ortografico manualmente. Per farlo, vai al menu Modifica e scegli Controllo ortografico o premi F7.
Tieni presente che il controllo ortografico non viene eseguito sui file di codice, ma solo sui file di documento (ovvero non avrai il controllo ortografico su un file .R, ma lo farai su un file .Rmd).
Di recente ho notato il controllo ortografico in tempo reale in OSX v.1.3.118 e versioni successive, che può essere scaricato da https://dailies.rstudio.com/