Il MOTD può essere stampato da sshd o tramite PAM. È possibile che lo stiano facendo entrambi.
Controlla il tuo /etc/ssh/sshd_config per quanto segue:
PrintMotd yes
Se quella riga non è presente, potrebbe essere il valore predefinito yes (sebbene Debian/Ubuntu cambi il valore predefinito in no ).
Controlla la tua configurazione PAM in /etc/pam.d/ per quanto segue:
session optional pam_motd.so
Prova a disabilitarli uno alla volta per vedere cosa cambia.