So che questo thread è molto vecchio e so che ne sei già a conoscenza,%sys --> se il ciclo viene speso in %system, gran parte dell'esecuzione viene eseguita nel codice di livello inferiore, ad esempio potrebbe essere un problema sul lato kernel. Se questo problema è nuovamente riproducibile, raccogli l'output di:
echo t > /proc/sysrq-trigger
E controlla i messaggi di sistema (var/log/messages o /var/log/syslog ) per vedere se qualche thread potrebbe utilizzare molto tempo della CPU di sistema.