df mostra valori negativi per used?

Soluzione 1:

Penso che questo potrebbe significare che sei andato oltre ciò che è riservato come spazio solo root (penso che l'impostazione predefinita sia 5% su ext3):

$ sudo tune2fs -l /dev/sda1 | grep -i 'Reserved block count'
Reserved block count:     1877194

Il conteggio dei blocchi riservati è una certa quantità di blocchi che solo l'utente root può utilizzare dopo che il disco è quasi pieno (questo impedisce a un utente normale di riempire il fs e causare problemi). Da man tune2fs :

   -m reserved-blocks-percentage 

Impostare la percentuale del filesystem che può essere allocata solo da processi privilegiati. Riservare un certo numero di blocchi di filesystem per l'uso da parte di processi privilegiati viene fatto per evitare la frammentazione del filesystem e per consentire ai demoni di sistema, come syslogd(8), di continuare a funzionare correttamente dopo che ai processi non privilegiati viene impedito di scrivere sul filesystem. Normalmente, la percentuale predefinita di blocchi riservati è del 5%.

Quindi penso che qualcosa stia occupando spazio velocemente come utente root. Puoi usare du -hcs / e approfondisci da lì per trovare dove si trovano i file che utilizzano lo spazio. Se pensi che potrebbe essere qualcosa che crea file di grandi dimensioni, puoi anche usare il find comando.

Soluzione 2:

Penso che sia una corruzione del file system. Dovresti smontare la partizione ed eseguire un file fsck.
Controlla anche i log e la console per eventuali errori del file system.