Probabilmente troverai utile la parte "Scelta del giusto supporto di installazione" della guida all'installazione.
install-x86-minimal-timestamp.iso è l'immagine del LiveCD. Lo masterizzi su un CD e lo avvii per entrare in un ambiente Gentoo minimo che puoi usare per installare Gentoo sul tuo sistema attuale
stage3-i486-timestamp.tar.bz2 (i686 per pentium 2 o superiore) è un tarball del filesystem root; ha /dev , /bin , ecc. Una delle prime cose che farai dopo aver avviato il LiveCD e aver partizionato i tuoi dischi è scaricare il tarball stage3 e decomprimerlo
Il file si chiama stage3 perché tecnicamente puoi iniziare a installare Gentoo da uno qualsiasi dei tre stadi, a seconda di quanta parte della build vuoi fare tu stesso (es., stage2 non include un sistema di base -- devi compilarlo tu stesso). stage3 è l'unico ufficialmente supportato e quasi certamente quello che vuoi usare
Il "minimo" è l'immagine del CD che funge solo da distribuzione live su cui eseguire l'installazione di Gentoo -- non contiene (o pochissimi) pacchetti, quindi è ancora necessaria una connessione a Internet mentre si è su quel CD. Oggi, molti installatori di Gentoo usano System Rescue CD invece delle immagini fornite da Gentoo. Questo passaggio è davvero solo per coloro che vogliono installare Gentoo sulla loro attuale partizione avviabile.
stage3 è un "livello superiore" dei vecchi stage 1. La fase 1 era la "base" da cui avresti iniziato a compilare. Oggi, la fase 3 fornisce più pacchetti già compilati, quindi il sistema è molto più facile da configurare. Stage1s richiederebbe agli utenti di eseguire molti bootstrap manuali (ricompilare con l'applicazione appena ricompilata... confonde, vero?).
Dovrai prendere lo stageX una volta che sei nell'ambiente in cui vuoi iniziare a costruire Gentoo, ed è altamente raccomandato oggi di iniziare con gli stage3, invece che con gli stage 1. Lo estrai e poi inizi a costruirci sopra. Vedere il manuale Gentoo per le istruzioni sulla compilazione dal tarball stage3.
Ad alcuni piace "ricompilare" i binari stage3 con i loro nuovi USE e CFLAGS, e questo viene fatto tramite bootstrap.
Buona fortuna con l'installazione di Gentoo! Questo è ciò che mi ha davvero portato a GNU/Linux, e spero che faccia lo stesso per te.