Copiare un file solo quando è più recente della destinazione

L'uso dell'opzione di aggiornamento (-u) con cp dovrebbe farlo per te.

http://beginnerlinuxtutorial.com/help-tutorial/basic-linux-commands/cp-linux-copy-command/

Usa rsync

rsync --progress -r -u /from/one/* /to/another/directory

Non stai dicendo quale shell stai usando, quindi assumerò ksh :

if [[ file1 -nt file2 ]]; then cp file1 file2; fi