pip3 sembra l'opzione predefinita pip utilizza. Prova a utilizzare pip2 invece di installare esplicitamente un pacchetto Python 2.
Basta cambiare la prima riga del /usr/local/bin/pip a:
#!/usr/bin/python
e la prima riga di /usr/local/bin/pip3 a:
#!/usr/bin/python3
E poi funzionerà normalmente:
> pip -V
pip 9.0.1 from /usr/local/lib/python2.7/dist-packages (python 2.7)
> pip3 -V
pip 9.0.1 from /usr/local/lib/python3.5/dist-packages (python 3.5)
python -m pip
Questo utilizzerà la versione di pip che python può vedere.