GNU/Linux >> Linux Esercitazione >  >> Linux

Alternativa a `memory.size()` di R in Linux?

Penso che questo dovrebbe essere gestito dal sistema operativo. Non esiste un limite integrato che io sappia; se necessario, R utilizzerà tutta la memoria che può ottenere.

Per ottenere informazioni sulla memoria totale e/o sulla memoria disponibile in Linux, puoi provare

system('grep MemTotal /proc/meminfo')

o

system('free -m')

o

system('lshw -class memory')

L'ultimo comando si lamenterà che dovresti eseguirlo come superutente e ti avvertirà che l'output potrebbe non essere accurato; ma dalla mia esperienza fornirà comunque un output abbastanza utile.

Per ottenere informazioni sull'utilizzo della memoria di uno script R in esecuzione, è possibile monitorare le risorse attualmente utilizzate avviando top in un terminale separato oppure utilizzare, ad esempio, la seguente chiamata di sistema dall'interno dello script R:

system(paste0("cat /proc/",Sys.getpid(),"/status | grep VmSize"))

Spero che questo aiuti.


Usando pryr libreria:

library("pryr")

mem_used()
# 27.9 MB

x <- mem_used()
x
# 27.9 MB
class(x)
# [1] "bytes"

Il risultato è lo stesso della risposta di @RHertel, con pryr possiamo assegnare il risultato in una variabile.

system('grep MemTotal /proc/meminfo')
# MemTotal:       263844272 kB

Per assegnare a una variabile con una chiamata di sistema, usa intern = TRUE :

x <- system('grep MemTotal /proc/meminfo', intern = TRUE)
x
# [1] "MemTotal:       263844272 kB"
class(x)
# [1] "character"

Linux
  1. Come modificare il nome host in Linux

  2. comando bat nel sistema Linux Ubuntu 20.04 LTS – alternativa al comando cat

  3. Come controllare l'utilizzo delle risorse di sistema con ulimit in Linux

  4. Come controllare la dimensione dell'heap per un processo su Linux

  5. Qual è la dimensione di una scrittura atomica su disco nel mio sistema?

Protezione di un sistema Linux ereditato

Introduzione di un amministratore di sistema Linux a cgroups

Documentare il tempo di attività del sistema in Linux

Ottimizzatore e monitoraggio del sistema Stacer Linux

Come elencare i servizi su Linux

Le migliori distribuzioni Linux alternative a Windows XP