Per evitare questo tipo di problemi dovresti installare il software solo da repository Debian nativi. Sfortunatamente non è insolito che pacchetti di terze parti sciatti/incompetenti siano responsabili di tali problemi.
Per recuperare prova a rimuovere il file /var/lib/dpkg/info/mongodb-org-server.postinst prima di tentare di apt-get purge mongodb .
Rimuovi tutti i file mongodb all'interno di
/var/lib/dpkg/info/mongodb
E poi fai
sudo apt purge mongodb-org*
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