Rimozione di parte di un nome file per più file su Linux

Prima di tutto usa 'sed -e' invece di '\e'

E ti suggerirei di farlo in questo modo in bash

for filename in *.fasta; do 
    [ -f "$filename" ] || continue
    mv "$filename" "${filename//test.extra/}"

done

Prova rename "extra.test" "" *

Oppure rename 's/extra.test//;' *

$ find
./extra.test-eggs.txt
./extra.testbar
./fooextra.test
./ham-extra.test-blah

$ rename "extra.test" "" *
$ find
./-eggs.txt
./bar
./foo
./ham--blah