Uso TextMate per eseguire un po' di hacking Flex sul mio computer di casa (un PowerBook G4 che non può eseguire FlexBuilder) e non ho problemi a scrivere applicazioni. Dipende se sei così abituato al supporto IDE da non poterne fare a meno. Mi piace il completamento del codice, la gestione dei progetti e il debugger in Flex Builder, ma posso farne a meno. TextMate non è gratuito, ma qualsiasi editor di testo con colorazione del codice per ActionScript andrebbe bene per me.
Di solito uso ant per gestire le mie build e questo è gratuito. Il Flex SDK è gratuito. Questo è tutto ciò di cui hai bisogno più un po' di pazienza.
Personalmente ho esperienza solo con la versione gratuita aplha di Flex builder per Linux costruita su Eclipse. Ma devo dire che è già abbastanza stabile e fornisce la maggior parte delle funzionalità presenti nelle versioni complete per mac osx e windows. Forse la cosa più fastidiosa che è manca l'editor gui per disporre rapidamente i moduli.
Se stai cercando un'altra opzione, tuttavia, forse questa ti sarà di aiuto:http://www.williambrownstreet.net/wordpress/?p=78
Non è un IDE però
Puoi utilizzare il plug-in fb4linux per Eclipse in http://code.google.com/p/fb4linux/ Funziona perfettamente con Eclipse 3.6 helios, puoi scegliere flex 3 o flex 4 sdk e non puoi riconoscere questo plug-in con il supporto Flex Builder sola versione di Adobe con luce alta, codice auto completo... buona fortuna.