Soluzione 1:
Gli errori "operazione non consentita" mi fanno pensare se NTP stia cercando di parlare o di aprire la sua porta privilegiata (123) ma non sia in esecuzione come root.
Puoi confermare che NTP è in esecuzione come root o è in esecuzione una versione con le autorizzazioni appropriate per aprire la porta 123?
Soluzione 2:
Ci sono messaggi ntpd in /var/log/messages? Mentre stavo affrontando i miei problemi con EC2 NTP, ho notato che a NTP non piaceva essere troppo fuori sincrono e volevo un aggiornamento manuale. Forse sei troppo lontano perché decida che si aggiornerà per te.