NVpy è "un'app multipiattaforma per prendere appunti con sincronizzazione delle note ispirata a Notational Velocity."
Guardando gli screenshot, NVpy sembra più simile a TomBoy.
Ecco un piccolo resoconto di NVpy su Lifehacker.
Anche se a questo ragazzo non è piaciuto e ha modificato un po' gvim.
Cercando di più, ho trovato NVVim che "è un clone dell'app Mac Notational Velocity in vim. È progettato per prendere e recuperare rapidamente appunti in testo normale."
TomBoy è un'applicazione per prendere appunti per Linux, che è probabilmente la cosa più vicina a Notational Velocity attualmente disponibile.