SonarSource ha aggiornato lo strumento Elasticsearch utilizzato come parte dell'ultima versione di SonarQube LTS. Di conseguenza SonarQube non può essere eseguito come root. Vedi questo blog e le note sull'aggiornamento di SonarQube 6.6 e questa domanda SO.
Cambia l'accesso root al file sonar. Prova a eseguirlo con il normale accesso utente.
chown <another user>:<user group> sonar.sh
Perché non è possibile trovare Read /run/user/1000/gvfs anche se è in esecuzione come root?
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