Ho riscontrato lo stesso problema su macchine ARM che utilizzano Docker. Sulla mia macchina python3-pip ha fornito una vecchia distribuzione pip (9.0.1). Quindi per me l'aggiornamento di pip &setuptools è stato sufficiente
pip3 install -U pip setuptools
Quindi puoi installare normalmente il resto delle tue dipendenze.
Ho risolto questo aggiornando il sistema operativo sul pi, quindi utilizzando il comando:
sudo apt-get install python3-pandas
I miei repository ora sono leggermente diversi rispetto al collegamento ai repository nella domanda, sono di seguito:
deb http://mirrordirector.raspbian.org/raspbian/ stretch main contrib non-free rpi
Se qualcuno è interessato, le specifiche sono ora le seguenti:
PRETTY_NAME="Raspbian GNU/Linux 9 (stretch)"
NAME="Raspbian GNU/Linux"
VERSION_ID="9"
VERSION="9 (stretch)"
ID=raspbian
ID_LIKE=debian
HOME_URL="http://www.raspbian.org/"
SUPPORT_URL="http://www.raspbian.org/RaspbianForums"
BUG_REPORT_URL="http://www.raspbian.org/RaspbianBugs"
Alla fine, con il nuovo sistema operativo non riuscivo ancora a pippare i panda di installazione, l'ho lasciato in esecuzione durante la notte senza successo