Un'altra soluzione (potrebbe non essere così elegante come sopra con $[QT_INSTALL_LIBS] ma l'ho già usata per un bel po' di tempo:
TEMPNAME = $${QMAKE_QMAKE}
QTPATH = $$dirname(TEMPNAME)
quindi puoi fare riferimento ad esso in questo modo (ad esempio per accedere ad alcune intestazioni private) o per copiare cose:
INCLUDEPATH += $$QTPATH/../../Src/qtbase/src/sql/kernel
Per Qt4 e Qt5, sembra $$[QT_INSTALL_LIBS] è quello che vuoi? Non posso confermare di prima mano che funzioni però.
Vedere https://forum.qt.io/topic/65778/qmake-and-qt-installation-root-directory/2 e http://doc.qt.io/qt-4.8/qmake-advanced-usage.html .