Come detto, Python 3.3 ha la chiamata - su Python 2.x, poiché è una semplice chiamata di sistema, che non richiede il passaggio di dati avanti e indietro, puoi usare ctypes per effettuare la chiamata:
>>> import ctypes
>>> libc = ctypes.CDLL("libc.so.6")
>>> libc.sync()
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Python 3.3 ha os.sync, vedi i documenti. La fonte conferma che è la stessa cosa.
Per Python 2 puoi effettuare una chiamata esterna al sistema:
from subprocess import check_call
check_call(['sync'])