Per ignorare i file in subversion devi impostare la proprietà svn:ignore. Puoi vedere di più qui http://svnbook.red-bean.com/en/1.8/svn.advanced.props.special.ignore.html circa a metà.
Per ignorare la cartella di destinazione dalla cartella del progetto eseguire
svn propset svn:ignore target .
In alternativa, per modificare un elenco di cartelle di file ignorati eseguire
svn propedit svn:ignore .
Prima di eseguire il commit del codice nel repository Subversion, impostiamo sempre la proprietà svn:ignore sulla directory per impedire che alcuni file e directory vengano archiviati. Escludiamo sempre i file di progetto IDE e la directory target/. Invece di tenere sempre a mente tutte le esclusioni, è utile inserirle tutte in un file e fare riferimento al file con l'opzione -F:
svn propset svn:ignore -F .svnignore .
Metti questo file nella cartella del progetto
.svnignore
target/*