Prendi in considerazione l'utilizzo di rsync
.
rsync -a -v --ignore-existing src dst
Come da commenti rsync -a -v src dst
non è corretto perché aggiornerà i file esistenti.
Preso dalla pagina man:
-n, --no-clobber
do not overwrite an existing file (overrides a previous -i option)
Esempio:
cp -n myoldfile.txt mycopiedfile.txt
cp -n
È quello che vuoi. Vedi la pagina man.